fbpx
Connect with us

Actualitate

Tot ce trebuie să știi despre noua variantă Covid 19 OMICRON, de la un profesor în genetică moleculară din SUA

Published

on

OMICRON – Noua variantă Covid19 apărută în Africa de Sud.

Tot ce trebuie să știi despre noua variantă Covid 19 OMICRON, de la un profesor în genetică moleculară din SUA

Varianta B.1.1.529 (clada 21K sau Omicron) a speriat comunitatea medicala mai tare decat Delta la aparitia sa. Asistam la o mobilizare intensa a guvernelor din aproape toate tarile lumii pentru a face fata acestei noi emenintari.

In doar o saptamana, B.1.1.529 a trecut din anonimatul sutelor de variante cu mutatii numeroase, la varianta sub monitorizare (VUM sau VBM) si apoi direct la VOC (varianta care produce ingrijorare), primind propriul sau nume oficial, Omicron.


,,În orice caz, avem o nouă variantă. Nasoală. Cu atât mai nasoală cu cât nivelurile de competență ale respondenților sunt cele pe care le cunoaștem. Singura consolare ar trebui să fie că, având în vedere nivelurile de competență ale răspunsurilor, ne putem aștepta ca, mai devreme sau mai târziu, virusul va înceta să mai evolueze. Pe același principiu al reginei roșii la care am făcut în mod repetat referire în legătură cu evoluționismul viral: “în natură, este necesar să fugi cât poți de repede pentru ca măcar să stai în același loc” (Lewis Carroll-Alice în țara oglinzii).
Varianta omicron a apărut cândva prin octombrie în Republica Sud-Africană. Cel mai probabil, ca urmare a infectării unui pacient sever imunodeprimat (probabil HIV netratat-infecția cu HIV are o prevalență mai mare de 30% în populația Africii de Sud), care a produs răspunsuri imune suboptimale. Care răspunsuri au obligat virusul să evolueze ca să le eludeze, dar pe de altă parte nu au fost capabile să-l elimine. Și în acest mod s-a produs o infecție persistentă SARS-CoV-2.
Am mai văzut cazuri din astea, unul dintre ele chiar la un pacient transplantat din Pittsburgh.
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33507235/
Bun. Ce a ieșit? Asta a ieșit. O variantă care are în total 50 de mutații, mai mult de 30 dintre acestea în structura proteinei spike și 10 in RBD (receptor binding domain), structura care se leagă la receptori și față de care sunt dirijați anticorpii neutralizanți, inclusiv cei din vaccin.


Mutații în structura proteinei spike – A67V, Δ69-70, T95I, G142D/Δ143-145, Δ211/L212I, ins214EPE, G339D, S371L, S373P, S375F, K417N, N440K, G446S, S477N, T478K, E484A, Q493K, G496S, Q498R, N501Y, Y505H, T547K, D614G, H655Y, N679K, P681H, N764K, D796Y, N856K, Q954H, N969K, L981F
Mutații altele decât în proteina spike- NSP3 – K38R, V1069I, Δ1265/L1266I, A1892T; NSP4 – T492I; NSP5 – P132H; NSP6 – Δ105-107, A189V; NSP12 – P323L; NSP14 – I42V; E – T9I; M – D3G, Q19E, A63T; N – P13L, Δ31-33, R203K, G204R


Cum citim mutațiile? Inițialele sunt aminoacizi.
• D614G. Înseamnă că în poziția 614 a glicoproteinei acidul aspartic (D) a fost înlocuit cu glicina (G). Aceasta este o mutație hipercunoscută, a survenit în tulpina wuhan atunci când a intrat prima oară în Europa anul trecut și a contribuit decisiv la pandemizarea SARS-CoV-2
• L452R. Substituirea, în poziția 452, a leucinei cu arginină: conferă o legare mai bună a proteinei spike la receptor și reduce capacitatea de recunoaștere de către sistemul imun.
• P681R. Înlocuirea, în poziția 681, a prolinei cu arginină. Este considerată a crește infecțiozitatea la nivel celular a virusului prin clivarea precursorului S în configurația active S1/S2.
Nu bun.
Veștile rele:
• Varianta omicron se raspândește cu rapiditate. Într-un grafic al răspândirii inițiale a variantelor virale, bate tot ce mișcă. Vedeți graficul.
• Sunt până în prezent identificate cazuri în Africa de Sud, Lesotho, Botswana, Zimbabwe, Mozambic, Namibia şi Eswatini, Hong Kong și Belgia. Poate or mai fi, dar n-am mai urmărit de vreo câteva ore.
• Mutațiile numeroase în RBD (și NTD) asociază rezistentă la anticorpii neutralizanți (inclusiv anticorpii monoclonali utilizați în terapie).
• Clusterul de mutații din vecinatatea situsului de clivare al furinei (H655Y+N679K+P681H) crește eficiența intrării virusului în celula și deci transmisibilitatea virusului.
• Deleția nsp106 (△105-107) care nu e nouă pentru omicron, poate genera antagonizarea interfenonilor, adică rezistența la imunitatea înnăscută, putând astfel mari transmisibilitatea.
• R203K+G204R sunt mutații care survin în afara domeniului spike, în nucleocapsida (erau în variantele Alfa, Gamma și Lambda) și sunt asociate cu infectivitate crescută.
• În Hong Kong, cei doi pacienți testați aveau încărcături virale extrem de ridicate (pozitivare la 17-18 cicluri de realtime), ceea ce sugerează o producție foarte mare de virus. Poate conduce atât la boala gravă, cât și la transmisibilitate crescută.
• Pacienții din Hong Kong erau în camere diferite, iar virusul a fost găsit răspândit larg în cele doua camere – ceea ce înseamnă că virusul este transmisibil prin aerosoli. Se transmite cu foarte mare ușurință (iar încărcăturile virale mari nu ne ajuta deloc).
Veștile bune:
• deleția △69-70 în gena S permite identificarea foarte ușoară a variantei omicron-deci trasabilitatea ei imediată.
• majoritatea regiunilor din genele N și RdRp, care sunt folosite pentru diagnostic prin testele de realtime PCR sunt conservate. Ceea ce înseamnă că testele vor funcționa pentru monitorizarea pacienților infectați cu varianta omicron.
• la fel, regiunile din structura nucleocapsidei recnoscute de testele rapide antigen nu sunt substanțial modificate și vor putea fi recunoscute. Deci testele funcționează încă.
• Unul din experții în biologie structurală a coronavirusurilor a sugerat că mutațiile combinate P681H și N679K sunt extrem de rare tocmai pentru că nu sunt stabile. A menționat însă că nu se știe cum sunt afectate aceste mutații de restul mutațiilor din structura omicron.
Ce nu știm?
• în ce măsură virusul are capacitate de a se răspândi masiv în lume înlocuind varianta delta. Care este transmisibilitatea acestui virus (i.e., este R0 mai mare, fiind continuată seria de creșteri cu fiecare nouă variantă)?
• în ce măsură infecția cu omicron are patogenicitate mai mare (i.e., letalitate și sechele mai mari). Se știe deja că unii pacienți pot rămâne în continuare asimptomatici.
Ce știm?
-că trebuie să ne protejăm. Purtați masca ori de câte ori sunteți în spații închise împreună cu alte persoane.
-nu ieșiți din casă dacă aveți febră. Nu vă lăsați colegii/angajații/elevii/studenții să vină la școală dacă au febră.
Din păcate, n-am ieșit din padure, și probabil că o să continuăm să o luăm de la capăt până când vom învăța că trebuie să facem și ce trebuie să facem nu numai ce avem chef.
În imagine, modul în care s-au răspândit inițial variantele virale în Republica Sud-Africană.”


Dr. Cristian Apetrei, profesor român în Departamentul de Microbiologie și Genetică Moleculară, membru în Centrul pentru Cercetarea Vaccinului și în Programul Postuniversitar în Microbiologie și Imunologie (PMI) de la Universitatea din Pittsburgh, SUA.

Citeste si: Simptomele pacienților infectați cu varianta Omicron sunt neobișnuite: bolnavii nu își pierd gustul și mirosul!

Click to comment

Leave a Reply

Adresa ta de email nu va fi publicată. Câmpurile obligatorii sunt marcate cu *

Ultimele Știri

Actualitate16 minute ago

Rafila: Până la sfârșitul lunii martie vom scăpa de o parte din restricții!

Ministrul Sănătății, Alexandru Rafila, a anunțat, într-un interviu pentru Digi24, că peste 3 săptămâni numărul infectărilor ar putea să scadă, iar...

Actualitate20 de minute ago

Prima țară din Europa care renunță la toate restricţiile anti-COVID-19. ,,Virusul NU mai reprezintă o amenințare pentru societate!”

Danemarca intenţionează să anuleze toate restricţiile interne anti-COVID-19 de la 1 februarie în pofida unui număr record de infectări noi,...

Actualitate26 de minute ago

27 ianuarie – Ziua Internațională de Comemorare a Victimelor Holocaustului

Ziua de 27 ianuarie marchează eliberarea lagărelor de concentrare naziste şi sfârşitul Holocaustului în care au fost ucişi 6 milioane...

Actualitate21 de ore ago

Cluj-Napoca a depășit incidența de 22 la mie, iar situația e gravă în mai multe localități din județ. Peste 1.000 de cazuri noi Covid

Rata incidenței COVID-19 a depășit 22 de cazuri la o mie de locuitori în municipiul Cluj-Napoca, iar situația este similară...

Actualitate22 de ore ago

Record ABSOLUT de cazuri Covid azi în România: peste 34.000 de teste pozitive

În ultimele 24 de ore au fost raportate peste 34.000 de cazuri noi de COVID-19, un record absolut de la...

Actualitate22 de ore ago

Forţe armate NATO noi vor fi amplasate în Europa de Est, inclusiv în România

NATO a anunţat luni că îşi va plasa forţele în stare de alertă şi va trimite mai multe nave şi...

Actualitate22 de ore ago

Zambile, lalele și narcise, produse în premieră de specialiștii horticoli de la USAMV Cluj-Napoca

Stațiunea de Cercetare Horticolă (SCH) din cadrul Universității de Științe Agricole și Medicină Veterinară (USAMV) Cluj-Napoca a produs, în premieră,...

Actualitate24 de ore ago

Spitalul din Câmpia Turzii va fi dotat în acest an cu un aparat RMN

Consiliul Județean Cluj a alocat noi resurse financiare care vor fi utilizate în scopul achiziționării de aparatură medicală. Spitalul din...

Actualitate24 de ore ago

Fosta fabrica Pfizer din Cluj-Napoca va deveni MALL. Clădirea a fost cumpărată de 3 milionari

O fabrică deţinută anterior de compania farma Pfizer a fost cumpărată de o companie controlată de trei oameni de afaceri...

Actualitateo zi ago

Noi cazuri de vaccinare la chiuvetă. Percheziții și dosare penale în mai multe județe din țară

Cinci percheziții au loc, în această dimineață, în judeţele Buzău, Giurgiu şi Ilfov, într-un dosar penal în care sunt efectuate...

Actualitateo zi ago

Copiii între 5 și 11 ani pot fi VACCINAȚI anti-Covid19, începând de azi. 200 de cabinete de imunizare pediatrică au fost deschise în țară

Vaccinarea copiilor cu vârste cuprinse între 5 și 11 ani începe miercuri. Imunizarea se face în centrele dedicate copiilor cu...

Actualitateo zi ago

INTERVIU cu marea noastră campioană la gimnastică, LARISA IORDACHE. (moderat de Amalia Hațegan)

Larisa Iordache este a doua cea mai titrată gimnastă din istoria Campionatelor Europene , deținând un palmares absolut impresionant, format...

Actualitateo zi ago

Inspectoratul Școlar Județean Cluj organizează Concursuri de schi fond cu elevii din medii dezavantajate ale județului Cluj

În perioada 22-23 ianuarie 2022, Inspectoratului Școlar Județean Cluj a desfășurat primele două concursuri de schi fond, din cadrul celor...

Actualitateo zi ago

Încep lucrările de modernizare pe strada Mihail Kogălniceanu din Cluj-Napoca

Primăria Cluj-Napoca anunță începerea lucrărilor de modernizare pe  strada Mihail Kogălniceanu, tronsonul cuprins între străzile Emmanuel de Martonne și Biserica Reformată. Lucrările vor...

Actualitate2 zile ago

Anglia elimină restricțiile rând pe rând. Vaccinații pot intra în țară fără testare Covid

Călătorii complet vaccinaţi care sosesc în Marea Britanie nu vor mai fi nevoiţi să facă un test COVID-19, a declarat,...

Actualitate2 zile ago

Alertă alimentară! Carne de pui infestată cu SALMONELLA în Metro

Rețeaua de hipermarketuri Metro a anunțat că retrage de pe piaţă un sortiment de pulpe de pui cu spate, după...

Actualitate2 zile ago

Nou RECORD de infectări cu Covid în România. Clujul e cap de listă cu incidența peste 16 la mie

În ultimele 24 de ore au fost înregistrate 19.685 de cazuri noi de persoane infectate cu SARS – CoV –...

Actualitate2 zile ago

Avram Gal, vicepreședintele ALDE, face dezvăluiri din culisele crizei energetice

Avram Gal, Vicepreședinte ALDE: Deși tensiunea socială a crescut la cote alarmante din pricina exploziei prețurilor, având drept cauză primară...

Actualitate2 zile ago

Peste 3800 de medici familie au încheiat contracte pentru testarea în cabinete pentru depistarea COVID-19. Vezi AICI lista cabinetelor!

Peste 3800 de medici familie au încheiat contracte pentru testarea în cabinete pentru depistarea COVID-19 la toți pacienții care se...

Actualitate2 zile ago

Ministerul Sănătății: TESTAREA RT-PCR la domiciliu sau în centrele de recoltare

Persoanele care prezintă simptomatologie specifică infecției cu virusul SARS-CoV-2, conform Metodologie INSP din data de 20.01.2022, (http://www.cnscbt.ro/index.php/informatii-pentru-personalul-medico-sanitar/2951-metodologia-de-supraveghere-a-covid-19-actualizare-20-01-2022), cu indicație de...

Tendințe